اهداف فصلنامه پدافند الکترونیکی و سایبری به شرح زیر می‌باشد:
1-دفاع سایبری(امنیت داده، تهدیدات نرم افزار، سیستم عامل، سخت افزار و شبکه، بدافزار، ضد بدافزار، هک و ...)
2-امنیت اطلاعات، رمزنگاری، پنهان نگری،پروتکل ها و استانداردها
3-آسیب پذیری ها و تهدیدات فضای سایبری
4- اخلال و فریب(مخابراتی، راداری، کنترل، مراقبت و ناوبری)
5- ردیابی، مکان یابی، آشکارسازی و شنود سیگنال
6- دفاع الکترونیک(لیزری، الکترواپتیکی، آکوستیکی)
7-مدل سازی و شبیه سازی دفاع الکترونیک و سایبری
8- فناوری های نوین دفاع الکترونیک و سایبری
9- فرماندهی و کنترل در پدافند الکترونیک و سایبری
10- مباحث دکترین، راهبردها و آینده پژوهی حوزه های مرتبط
11- پردازش سیگنال حوزه های مرتبط